RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 KIFC1Q9BW19 673 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.323e-10■□□□□ 10.4
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PRAME-213ENST00000492657 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.04□□□□□ -0.32
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PRAME-213ENST00000492657 ZMPSTE24O75844 475 aa13.03□□□□□ -0.32
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PRAME-213ENST00000492657 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.03□□□□□ -0.32
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PRAME-213ENST00000492657 CNTN5O94779 1100 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 CYP2C18P33260 490 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 MAXP61244 160 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 SEPT6Q14141 434 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 LINC00523Q86TU6 105 aa13.03□□□□□ -0.32
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PRAME-213ENST00000492657 SCUBE1Q8IWY4 988 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-213ENST00000492657 ULK2Q8IYT8 1036 aa13.03□□□□□ -0.32
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