RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 DHX58Q96C10 678 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 OTUB2Q96DC9 234 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SDCBP2Q9H190 292 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CD248Q9HCU0 757 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 UBE4BO95155 1302 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CACNA1GO43497 2377 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 AKAP13Q12802 2813 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CACNA1EQ15878 2313 aa6.71□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 PATE3B3GLJ2 98 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 AQP7O14520 342 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 NOBOXO60393 691 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 BEST1O76090 585 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 APODP05090 189 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PROS1P07225 676 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM153BP0C7A2 387 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CEACAM1P13688 526 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CASP4P49662 377 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP2J2P51589 502 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 AP3M2P53677 418 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC5A3P53794 718 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TNNC1P63316 161 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 STK4Q13043 487 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ADAM9Q13443 819 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TRPC3Q13507 836 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CUL4BQ13620 913 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 HECTD3Q5T447 861 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RESP18Q5W5W9 173 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ANO7Q6IWH7 933 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 HTR3DQ70Z44 454 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM25Q86YD3 366 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FUKQ8N0W3 1084 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FRMD1Q8N878 549 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RLN3Q8WXF3 142 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPRN2Q92932 1015 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO32Q969P5 355 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 WBP2Q969T9 261 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SMOQ99835 787 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 EDEM2Q9BV94 578 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 IPPKQ9H8X2 491 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO10Q9UK96 956 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PQF6 199 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 HHLA1C9JL84 531 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.342e-15■□□□□ 10
PRPF40A-210ENST00000489741 IKBKBO14920 756 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 EXOC3O60645 756 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TULP3O75386 442 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ALDH1A2O94788 518 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CISD3P0C7P0 127 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PTGER3P43115 390 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 GAD2Q05329 585 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PAK1Q13153 545 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RTP5Q14D33 572 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZACNQ401N2 412 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 EOGTQ5NDL2 527 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ATL3Q6DD88 541 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PIP4P1Q86T03 277 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM124AQ86V42 546 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 UNC93AQ86WB7 457 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SYT12Q8IV01 421 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF276Q8N554 614 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms