RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MTSS1LQ765P7 747 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HOMEZQ8IX15 550 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PANX3Q96QZ0 392 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GBA3Q9H227 469 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TGM5O43548 720 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PRNPP04156 253 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RBP1P09455 135 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 OR56A5P0C7T3 313 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 KDSRQ06136 332 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PDGFRLQ15198 375 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBCCQ15814 346 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CES3Q6UWW8 571 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 H3BMM5 538 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FAM153BP0C7A2 387 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HMOX2P30519 316 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ABL2P42684 1182 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FAM153CQ494X1 144 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 BEND5Q7L4P6 421 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MYO19Q96H55 970 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF599Q96NL3 588 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SYCE1LA8MT33 242 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FAM189A1O60320 539 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PPFIA2O75334 1257 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MYO1DO94832 1006 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 DNTTP04053 509 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 IFT88Q13099 833 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 KIF19Q2TAC6 998 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RTL10Q7L3V2 364 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PSMG2Q969U7 264 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 E2F8A0AVK6 867 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 COCHO43405 550 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 NDST3O95803 873 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 KITP10721 976 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CRABP2P29373 138 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ARFIP2P53365 341 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GYS2P54840 703 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CERS2Q96G23 380 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf74Q96LT6 269 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 A8MX80 341 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF487B1APH4 448 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 DIAPH2O60879 1101 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 CXCL10P02778 98 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MPOP05164 745 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HIC1Q14526 733 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LINGO4Q6UY18 593 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FAM161BQ96MY7 647 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RNF112Q9ULX5 631 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LZTS1Q9Y250 596 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 EPHX1P07099 455 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PTPN3P26045 913 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PHEXP78562 749 aa8.37□□□□□ -1.07
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