RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	ARSA	P15289	507 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CHN1	P15882	459 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DPP6	P42658	865 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TEC	P42680	631 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NEK3	P51956	506 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SRL	Q86TD4	932 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TULP2	O00295	520 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	FFAR2	O15552	330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ACP5	P13686	325 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DCTD	P32321	178 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	STARD3	Q14849	445 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1B0GVM2	712 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CGA	P01215	116 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	AP2B1	P63010	937 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	BTK	Q06187	659 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DLG1	Q12959	904 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MYBPH	Q13203	477 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CPT1B	Q92523	772 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	LHPP	Q9H008	270 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CLPB	Q9H078	707 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SYT5	O00445	386 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CYP4B1	P13584	511 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SERPINA4	P29622	427 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SERPINF1	P36955	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PICALM	Q13492	652 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A087WV62	115 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CKMT1A	P12532	417 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MTNR1A	P48039	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	GLIPR1	P48060	266 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MVD	P53602	400 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DDR1	Q08345	913 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SNTA1	Q13424	505 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NAGS	Q8N159	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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