RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484331.5

RAPGEF4-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 4, human

TSL 4

Gene RAPGEF4, Length 547 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TCEA2	Q15560	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CDT1	Q9H211	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LIAS	O43766	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TTC4	O95801	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GH1	P01241	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LGALS2	P05162	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PGK2	P07205	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CLTB	P09497	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CXCL8	P10145	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CD58	P19256	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	IVD	P26440	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	KLRC2	P26717	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TMOD1	P28289	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CSF2RB	P32927	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GJC1	P36383	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ADCY8	P40145	1251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CLCN3	P51790	818 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	RABGGTB	P53611	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ITGA8	P53708	1063 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	IL13RA1	P78552	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SNX1	Q13596	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	STIL	Q15468	1287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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