RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 TTI2Q6NXR4 508 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 SARM1Q6SZW1 724 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 AMER2Q8N7J2 671 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 FAR1Q8WVX9 515 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 SARAFQ96BY9 339 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PRRX2Q99811 253 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF747Q9BV97 191 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 TM2D2Q9BX73 214 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 NLKQ9UBE8 527 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 MKLN1Q9UL63 735 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHGB4Q9UN71 923 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PASKQ96RG2 1323 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PQF6 199 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 CXorf65A6NEN9 183 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC53A6NM62 1247 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 TAF4O00268 1085 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 INPPL1O15357 1258 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 P4HA2O15460 535 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 GJB3O75712 270 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 NFATC1O95644 943 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PLAUP00749 431 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 IL1AP01583 271 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 HEXAP06865 529 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 IRF1P10914 325 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 TFEBP19484 476 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ARSFP54793 590 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEP78395 509 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 BECN1Q14457 450 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ME3Q16798 604 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNDC8Q6A555 127 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL35Q6PF15 583 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZPA2 131 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 MOB3CQ70IA8 216 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT74Q7RTS7 529 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 CHSY1Q86X52 802 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF398Q8TD17 642 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 ASB2Q96Q27 587 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP26Q9BV47 211 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 KAT14Q9H8E8 782 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0A0MQY5 61 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PRG0 241 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CBY3A6NI87 242 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 A8MZ25 164 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SMIM22K7EJ46 135 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PGM3O95394 542 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXB5P09067 269 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RARGP13631 454 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC2A4P14672 509 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ACSL1P33121 698 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC12A2P55011 1212 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 STK4Q13043 487 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC96Q2M329 555 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF627Q7L945 461 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT77Q7Z794 578 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GPAT4Q86UL3 456 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms