RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-DQB2P05538 268 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ADCY8P40145 1251 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CSNK1DP48730 415 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ZXDAP98168 799 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 RAD51Q06609 339 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC32Q14392 662 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF234Q14588 700 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRNQ16849 979 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 IER5LQ5T953 404 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SIX5Q8N196 739 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CNTD1Q8N815 330 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 BBOF1Q8ND07 529 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC45Q96CN5 670 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 FCRL5Q96RD9 977 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 MGME1Q9BQP7 344 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP41Q9BYV8 373 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 GBA3Q9H227 469 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 KRBA1A5PL33 1030 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC34A8MYJ7 566 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 INSIG1O15503 277 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ANXA9O76027 345 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINF2P08697 491 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ETS1P14921 441 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 NFKB1P19838 968 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CA4P22748 312 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 NTSR1P30989 418 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TIE1P35590 1138 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SCNN1BP51168 640 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 NRLP54845 237 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 GEMP55040 296 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC13P55735 322 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 MAXP61244 160 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 AP1S1P61966 158 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 GPS1Q13098 491 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ENPP2Q13822 863 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CCINQ13939 588 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 GRM3Q14832 879 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC14A2Q15849 920 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CARD16Q5EG05 197 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 EMC10Q5UCC4 262 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 PCGF5Q86SE9 256 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CHPFQ8IZ52 775 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 PGBD5Q8N414 524 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 FRS2Q8WU20 508 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO19Q96H55 970 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA3CQ99985 751 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 ERP44Q9BS26 406 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM245Q9H330 911 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 CD320Q9NPF0 282 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS45Q9NRW7 570 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 LHX3Q9UBR4 397 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms