RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DISC1C4P0D8 188 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TCEA3O75764 348 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KRT33AO76009 404 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SERPING1P05155 500 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC3BP05452 202 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 QDPRP09417 244 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GPR89BP0CG08 455 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CCNB1P14635 433 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GABPAQ06546 454 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SCN1BQ07699 218 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC39A14Q15043 492 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PPA1Q15181 289 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NPTX1Q15818 432 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BCL2A1Q16548 175 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MROH9Q5TGP6 573 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MYLPFQ96A32 169 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MYL10Q9BUA6 226 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TMED9Q9BVK6 235 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MED28Q9H204 178 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CRLF2Q9HC73 371 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 USE1Q9NZ43 259 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF197O14709 1029 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TPST1O60507 370 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GDF11O95390 407 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TALDO1P37837 337 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MMP13P45452 471 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NR1I3Q14994 352 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MCPH1Q8NEM0 835 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RSC1A1Q92681 617 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ISOC1Q96CN7 298 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 USP29Q9HBJ7 922 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PSME2Q9UL46 239 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MAPKBP1O60336 1514 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A8MUA0 341 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AP2A2O94973 939 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GJB6O95452 261 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AMPD1P23109 780 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.52e-7■■■□□ 15.8
PTPRC-209ENST00000442510 MEOX2P50222 304 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DYRK1AQ13627 763 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ALCAMQ13740 583 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GRK1Q15835 563 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC43A2Q8N370 569 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KYQ8NBH2 561 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NCSTNQ92542 709 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CORO2AQ92828 525 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf90Q96M02 699 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DSCC1Q9BVC3 393 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HDHD2Q9H0R4 259 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 VPS54Q9P1Q0 977 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C2CD2LO14523 706 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TOR1BO14657 336 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF213O14771 459 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0355O15063 1070 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MSH4O15457 936 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TDP2O95551 362 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FUCA1P04066 466 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EPB42P16452 691 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CACNB3P54284 484 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HERVK_113P62684 666 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ERVK-9P63128 1117 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ERVK-24P63145 666 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KCNJ10P78508 379 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MGAT5Q09328 741 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms