RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINB8P50452 374 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PDPK2PQ6A1A2 396 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC8BQ6P9F7 803 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PPCSQ9HAB8 311 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 STMN1P16949 149 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 YWHAQP27348 245 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 WNT3AP56704 352 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 DENND1CQ8IV53 801 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 BTBD10Q9BSF8 475 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 C20orf27Q9GZN8 174 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PIF1Q9H611 641 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GPAMQ9HCL2 828 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GKN1Q9NS71 199 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 XPR1Q9UBH6 696 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ACOT9Q9Y305 439 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FYNP06241 537 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ZCCHC18P0CG32 403 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 WEE1P30291 646 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FKBP1BP68106 108 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ESAMQ96AP7 390 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NXNL1Q96CM4 212 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SEMA3CQ99985 751 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 DCDC2Q9UHG0 476 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PAMP19021 973 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CCND1P24385 295 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SEMA5AQ13591 1074 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GSTCDQ8NEC7 633 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V1E2Q96A05 226 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SMIM14Q96QK8 99 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TM6SF2Q9BZW4 377 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 THAP1Q9NVV9 213 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM17Q9Y577 477 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HACD1B0YJ81 288 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 E9PAM4 449 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 I6L893 689 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNQ1P51787 676 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 USP46P62068 366 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 UPP1Q16831 310 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 OR7D4Q8NG98 312 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HDAC10Q969S8 669 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HMCESQ96FZ2 354 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCC13Q9NSE7 274 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 OR1D2P34982 312 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PLD1Q13393 1074 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SPDYAQ5MJ70 313 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 C17orf99Q6UX52 265 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TREML1Q86YW5 311 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC134Q9H6E4 229 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ALG9Q9H6U8 611 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 BATF3Q9NR55 127 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GGA2Q9UJY4 613 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ITM2BQ9Y287 266 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 WASF2Q9Y6W5 498 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 AURKAO14965 403 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 RAMP2O60895 175 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CARNMT1Q8N4J0 409 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL33A6NCF5 533 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINE1P05121 402 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-DQB2P05538 268 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIA4P48058 902 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ACLYP53396 1101 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ALFQ53S48 1182 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NEPROQ6NW34 567 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SCUBE1Q8IWY4 988 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNT4Q8N4A0 578 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM81AQ8TBF8 368 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS2R1Q9NYW7 299 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 E7ESA3 106 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GIPC1O14908 333 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TPST1O60507 370 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PLIN3O60664 434 aa13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms