RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 TSC1Q92574 1164 aa20.51■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 GBP4Q96PP9 640 aa20.51■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 FZD3Q9NPG1 666 aa20.51■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 DYRK4Q9NR20 520 aa20.51■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.51■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 KRT3P12035 628 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 MAPKAPK2P49137 400 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CARD16Q5EG05 197 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 WDR59Q6PJI9 974 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 MON1BQ7L1V2 547 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 NTAN1Q96AB6 310 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 DKK4Q9UBT3 224 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 DNAI1Q9UI46 699 aa20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 THEGLP0DJG4 465 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 GPD1P21695 349 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ITGB7P26010 798 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 NEK3P51956 506 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CLDN6P56747 220 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 UBXN1Q04323 297 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 APC2O95996 2303 aa20.49■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 SDC3O75056 442 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 RFPL3O75679 317 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CALB1P05937 261 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ADRB3P13945 408 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 L1CAMP32004 1257 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ETFBP38117 255 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 FGL2Q14314 439 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PLPP6Q8IY26 295 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 OR13H1Q8NG92 308 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 AGPAT1Q99943 283 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 MAGEH1Q9H213 219 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CCP110O43303 1012 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PCDH8O95206 1070 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ATP1A3P13637 1013 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 AKT2P31751 481 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 GKP32189 559 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 DNA2P51530 1060 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 CLDN2P57739 230 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 SLC25A45Q8N413 288 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 BMFQ96LC9 184 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 SYT11Q9BT88 431 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 GPR27Q9NS67 375 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ACACAQ13085 2346 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 AP1G1O43747 822 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 RAMP2O60895 175 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 C1SP09871 688 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ABL2P42684 1182 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 PROX2Q3B8N5 592 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 BAP1Q92560 729 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 LHX6Q9UPM6 363 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ITPR1Q14643 2758 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-250ENST00000434333 ADAMTS20P59510 1910 aa20.45■□□□□ 0.86
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM38O00635 465 aa20.45■□□□□ 0.86
HLA-B-250ENST00000434333 RAD51BO15315 384 aa20.45■□□□□ 0.86
HLA-B-250ENST00000434333 SPINT1O43278 529 aa20.45■□□□□ 0.86
HLA-B-250ENST00000434333 GSRP00390 522 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms