RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 LATO43561 262 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DFNA5O60443 496 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 STX10O60499 249 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RFPL3O75679 317 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ASLP04424 464 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PAEPP09466 180 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 JUPP14923 745 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GOT1P17174 413 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC11A2P49281 568 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CCR5P51681 352 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ST8SIA6P61647 398 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SEMG2Q02383 582 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RTP5Q14D33 572 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM270Q6UE05 265 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TAC4Q86UU9 113 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TREML1Q86YW5 311 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 KDM1BQ8NB78 822 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FRS2Q8WU20 508 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SERAC1Q96JX3 654 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 OMDQ99983 421 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SARDHQ9UL12 918 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FZD4Q9ULV1 537 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SCML1Q9UN30 329 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 KNTC1P50748 2209 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQ27 194 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQ64 194 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC72A6NJI9 287 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TLR4O00206 839 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RNF103O00237 685 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RTN2O75298 545 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV3-25P01717 112 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FOSL1P15407 271 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ABCB4P21439 1286 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TACR2P21452 398 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 EPHA1P21709 976 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GPD2P43304 727 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RXRGP48443 463 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FMO5P49326 533 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 KRT85P78386 507 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ECT2LQ008S8 904 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 INAVAQ3KP66 663 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RRAGAQ7L523 313 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LGI2Q8N0V4 545 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NXPE2Q96DL1 559 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ALG14Q96F25 216 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 HSFY1Q96LI6 401 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GDF3Q9NR23 364 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM38O00635 465 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 BRINP1O60477 761 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SDC3O75056 442 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 IL1BP01584 269 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 F13BP05160 661 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 C1SP09871 688 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GIMD1P0DJR0 217 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PDGFRAP16234 1089 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 C5AR1P21730 350 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R38P59533 333 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CDH18Q13634 790 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms