RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		10.22	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089		E9PAM4	449 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089		F8W810	466 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	BIRC5	O15392	142 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	USP1	O94782	785 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	TGDS	O95455	350 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	JCHAIN	P01591	159 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	GALT	P07902	379 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	OR4Q2	P0C623	313 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	PYGB	P11216	843 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	CCNB1	P14635	433 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	RHOQ	P17081	205 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	MGAT1	P26572	445 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	CRHR1	P34998	444 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	HADHA	P40939	763 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	ETV4	P43268	484 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC11A1	P49279	550 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	GEM	P55040	296 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	TBX4	P57082	545 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	PPARD	Q03181	441 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	TNK2	Q07912	1038 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	CDH17	Q12864	832 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	CRYM	Q14894	314 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	INSC	Q1MX18	579 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	GRTP1	Q5TC63	336 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	FYB2	Q5VWT5	728 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM135	Q86UB9	458 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SIX5	Q8N196	739 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	ATP2A3	Q93084	1043 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SERAC1	Q96JX3	654 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	CPNE1	Q99829	537 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	NMUR1	Q9HB89	426 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	MARCH5	Q9NX47	278 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	NEU3	Q9UQ49	428 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.21	□□□□□ -0.77
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF292	O60281	2723 aa		10.21	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		10.21	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MTMR11	A4FU01	709 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DRGX	A6NNA5	263 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PI15	O43692	258 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RFPL1	O75677	317 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DCTN3	O75935	186 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ATP5H	O75947	161 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CPB1	P15086	417 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NFKB1	P19838	968 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GRIA1	P42261	906 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	POLD2	P49005	469 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RENBP	P51606	427 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MTM1	Q13496	603 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DDR2	Q16832	855 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MPP5	Q8N3R9	675 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	FBXO32	Q969P5	355 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZBP1	Q9H171	429 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GLOD4	Q9HC38	313 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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