RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 SYBUQ9NX95 663 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF145Q96MT1 663 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS51Q9UID3 782 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 ANXA5P08758 320 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 TTPAP49638 278 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 ARCQ7LC44 396 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 XYLT1Q86Y38 959 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6C75A6NL08 312 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM58BPP0C7Q3 252 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB10P61026 200 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC142Q17RM4 750 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 CORO1BQ9BR76 489 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL28Q9NXS3 571 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 KLQ9UEF7 1012 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 HPGDP15428 266 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 NOMO1Q15155 1222 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 STK39Q9UEW8 545 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 LCA5LO95447 670 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PKNOX1P55347 436 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 STK32AQ8WU08 396 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PIK3C2AO00443 1686 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3BGRLO75368 114 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PIRTP0C851 137 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 GRIA4P48058 902 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS7P62081 194 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 IL5RAQ01344 420 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRNQ16849 979 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX10O60683 326 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ADRA1BP35368 520 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 FLT3P36888 993 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 FSBPO95073 299 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 LRPAP1P30533 357 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 SYT12Q8IV01 421 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 FUKQ8N0W3 1084 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOC2Q96KP1 924 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 IGFLR1Q9H665 355 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 IRF8Q02556 426 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF43Q68DV7 783 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 EID3Q8N140 333 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK18Q07002 472 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 CTBP1Q13363 440 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 NPY5RQ15761 445 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MON1BQ7L1V2 547 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR152Q8TDT2 470 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 CREMQ03060 361 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2A13Q16696 494 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF384Q8TF68 577 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 SELENOMQ8WWX9 145 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 OMDQ99983 421 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 COG5Q9UP83 839 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP3K13O43283 966 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 POTEHQ6S545 545 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF398Q8TD17 642 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS5O15539 181 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 TREHO43280 583 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PAGE1O75459 146 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MTA2O94776 668 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 JAM2P57087 298 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGA7Q13683 1181 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 STK32CQ86UX6 486 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 TRABD2AQ86V40 505 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms