RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LZTR1Q8N653 840 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC26Q8NHZ8 85 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC35C1Q96A29 364 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CITED4Q96RK1 184 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NDNQ99608 321 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DEC1Q9P2X7 70 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ENOPH1Q9UHY7 261 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CACNA1FO60840 1977 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 B4GALT4O60513 344 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PMPCBO75439 489 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SPAG6O75602 509 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TPPPO94811 219 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CLUP10909 449 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CYBAP13498 195 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SCTRP47872 440 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RGS4P49798 205 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBP50607 506 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SCNN1BP51168 640 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 COPAP53621 1224 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NR1H2P55055 460 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC34A1Q06495 639 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM32Q13049 653 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NR1I3Q14994 352 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFP69Q49AA0 526 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HYIQ5T013 277 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MARC1Q5VT66 337 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C4orf22Q6V702 233 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00523Q86TU6 105 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MON1AQ86VX9 555 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf54Q8WWF1 131 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LENG9Q96B70 501 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SHDQ96IW2 340 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NUAK2Q9H093 628 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS11Q9H270 941 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TLR9Q9NR96 1032 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PAK5Q9P286 719 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GSAPA4D1B5 854 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TEX46H3BTG2 121 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 H7C2Y5 167 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT36O76013 467 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINF2P08697 491 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 THRAP10827 490 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MSH3P20585 1137 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP4AP20648 1035 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TYK2P29597 1187 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NOS2P35228 1153 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CLK2P49760 499 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINB9P50453 376 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARSEP51690 589 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGDIBP52566 201 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC6A3Q01959 620 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CHRNB3Q05901 458 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF846Q147U1 533 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 UGP2Q16851 508 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFP1Q6P2D0 407 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NEK5Q6P3R8 708 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PIGZQ86VD9 579 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms