RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PSMD8P48556 350 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ARF5P84085 180 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SPEM2Q0P670 501 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PPP2R5EQ16537 467 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 USP30Q70CQ3 517 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 RFX6Q8HWS3 928 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 FOXJ1Q92949 421 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 RNF157Q96PX1 679 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 USP34Q70CQ2 3546 aa21.18■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 DMDP11532 3685 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SERPINB6P35237 376 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 TFDP2Q14188 446 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 CSRP2Q16527 193 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 TAZQ16635 292 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ARMCX6Q7L4S7 300 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 LZTR1Q8N653 840 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 GANCQ8TET4 914 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 TLR10Q9BXR5 811 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 VPS45Q9NRW7 570 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.17■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 RASA4BC9J798 803 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 K7ERQ8 282 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 APOL1O14791 398 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 MCF2LO15068 1137 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 MID1O15344 667 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 RASA4O43374 803 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 BNIP3LO60238 219 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 IL1BP01584 269 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PYGMP11217 842 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 C5AR1P21730 350 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 HOXD12P35452 270 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PTGER3P43115 390 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 NDST2P52849 883 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 FAM124AQ86V42 546 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 FAM129BQ96TA1 746 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 GPR174Q9BXC1 333 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SGK2Q9HBY8 427 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 FZD4Q9ULV1 537 aa21.16■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 MEI4A8MW99 385 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 KCNK3O14649 394 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ENC1O14682 589 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 KDELR3O43731 214 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SLC8A1P32418 973 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PTPN7P35236 360 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 LMNB2Q03252 620 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF33AQ06730 810 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 KAZNQ674X7 775 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PQLC3Q8N755 202 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 HMCESQ96FZ2 354 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 OMDQ99983 421 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 CARD9Q9H257 536 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.15■□□□□ 0.98
C4orf48-201ENST00000409248 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 SEMA4FO95754 770 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 KRT10P13645 584 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 SERINC3Q13530 473 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 SYT12Q8IV01 421 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 NPWQ8N729 165 aa21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
C4orf48-201ENST00000409248 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms