RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMD8P48556 350 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNA2P51530 1060 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RENBPP51606 427 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RWDD2BP57060 319 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHOAP61586 193 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAD51Q06609 339 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF33AQ06730 810 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRM3Q14832 879 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP2R5EQ16537 467 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX26Q7Z412 305 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BBS5Q8N3I7 341 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXJ1Q92949 421 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEPT3Q9UH03 358 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL36AQ9UHA7 158 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR23AA6NEV1 266 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MID1O15344 667 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFSD11O43934 449 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BNIP3LO60238 219 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAFKO60675 156 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFS2O75306 463 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RETP07949 1114 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCKDHBP21953 392 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPN7P35236 360 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPK8P45983 427 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSNK1DP48730 415 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NR2C2P49116 596 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYTH1Q15438 398 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYLK3Q32MK0 819 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RFX6Q8HWS3 928 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLD5Q8N7P1 536 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT35Q92764 455 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSGA13Q96PP4 275 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSKH2Q96QS6 385 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OMDQ99983 421 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DYRK4Q9NR20 520 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXL12Q9NXK8 326 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DTLQ9NZJ0 730 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INVSQ9Y283 1065 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0U1RQJ8 604 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGM2P21980 687 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNCP24863 283 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXD12P35452 270 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX5P50542 639 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GBE1Q04446 702 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CACUL1Q86Y37 369 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHST14Q8NCH0 376 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GANCQ8TET4 914 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RUBCNQ92622 972 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDAC11Q96DB2 347 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LHX3Q9UBR4 397 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMACRQ9UHK6 382 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PP55 124 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms