RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378863.8

CRLS1-201, Transcript of cardiolipin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRLS1, Length 3,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1-201ENST00000378863 RHOBTB1O94844 696 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 GRK2P25098 689 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 WNT3AP56704 352 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 DSC2Q02487 901 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 NEPROQ6NW34 567 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 23.2
CRLS1-201ENST00000378863 SERPINB11Q96P15 392 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.034e-9■■■■□ 26.2
CRLS1-201ENST00000378863 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.89□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 DSG1Q02413 1049 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 GRIK3Q13003 919 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MOGSQ13724 837 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 GCNAQ96QF7 691 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 GKN1Q9NS71 199 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 NEMP2A6NFY4 417 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 PEX1O43933 1283 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 SNX2O60749 519 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 RAG1P15918 1043 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 LINC00523Q86TU6 105 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MPSTP25325 297 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 IRF9Q00978 393 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ZBTB17Q13105 803 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 PTPRCAPQ14761 206 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 AGKQ53H12 422 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 UBXN11Q5T124 520 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 CGB2Q6NT52 195 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 HPS6Q86YV9 775 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 HDAC10Q969S8 669 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 YME1L1Q96TA2 773 aa14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 C9JVG2 144 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MGEA5O60502 916 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 OR7D4Q8NG98 312 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 PSMG2Q969U7 264 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 F5P12259 2224 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 INHAP05111 366 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 RHOCP08134 193 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 IL4RP24394 825 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 LPCAT4Q643R3 524 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 CCNJLQ8IV13 435 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 APPL1Q9UKG1 709 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 HACD1B0YJ81 288 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 AKAP10O43572 662 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 CYP2C18P33260 490 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 SLC11A2P49281 568 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 NOGQ13253 232 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 RIPK1Q13546 671 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 MAP7Q14244 749 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 KCNJ11Q14654 390 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 CPNE1Q99829 537 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 ALG9Q9H6U8 611 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.87□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 TPBGLP0DKB5 382 aa14.86□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 GRIA4P48058 902 aa14.86□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 RENBPP51606 427 aa14.86□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CRLS1-201ENST00000378863 LPIN1Q14693 890 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms