RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 HLA-DPA1P20036 260 aa18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 ATP6V1E1P36543 226 aa18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 PACS1Q6VY07 963 aa18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 DSG4Q86SJ6 1040 aa18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 NETO2Q8NC67 525 aa18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 PCED1BQ96HM7 432 aa18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 FGF1P05230 155 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 L1CAMP32004 1257 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 MAXP61244 160 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 AP4S1Q9Y587 144 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 ALS2Q96Q42 1657 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 CLPTM1O96005 669 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 SLC2A4P14672 509 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 TEKT2Q9UIF3 430 aa18.77■□□□□ 0.6
GALNT2-201ENST00000366672 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 VPS4BO75351 444 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 PTGIRP43119 386 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 PIK3CGP48736 1102 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TTPAP49638 278 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLC5A3P53794 718 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 KCNJ2P63252 427 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLC44A1Q8WWI5 657 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 ARHGEF4Q9NR80 690 aa18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 A0A1W2PQH9 124 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MRASO14807 208 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 APOA1P02647 267 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLC20A2Q08357 652 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CYP1B1Q16678 543 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TRIM48Q8IWZ4 208 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 GPR152Q8TDT2 470 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 AGAP11Q8TF27 550 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CAPNS2Q96L46 248 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 DPY30Q9C005 99 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 A0A1W2PPM1 405 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MFSD11O43934 449 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CD48P09326 243 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 OR4Q2P0C623 313 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 RAB10P61026 200 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 STARD3Q14849 445 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TMEM192Q8IY95 271 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 ALG9Q9H6U8 611 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TAF5Q15542 800 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 IRGCQ6NXR0 463 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 OOSP2Q86WS3 158 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 Q9Y3F1 56 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 C5orf60A6NFR6 353 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TBL1XO60907 577 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 PCDH8O95206 1070 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 ATG7O95352 703 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 PSMG1O95456 288 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 DGKAP23743 735 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 LMO2P25791 158 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CACNA2D1P54289 1103 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 DAOAP59103 153 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 24.5
GALNT2-201ENST00000366672 CDRT15Q96T59 188 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 ASB8Q9H765 288 aa18.76■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TYMPP19971 482 aa18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CORO1BQ9BR76 489 aa18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa18.75■□□□□ 0.59
GALNT2-201ENST00000366672 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms