RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A12Q96S37 553 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CAPN10Q9HC96 672 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CITO14578 2027 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQJ5 194 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM24O15164 1050 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ADH1BP00325 375 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RETP07949 1114 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GLI1P08151 1106 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35G4P0C7Q5 338 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CD38P28907 300 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ADRA1BP35368 520 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CARD16Q5EG05 197 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FIGNQ5HY92 759 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NCEH1Q6PIU2 408 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DET1Q7L5Y6 550 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IRGQQ8WZA9 623 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HAPLN3Q96S86 360 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PISDQ9UG56 409 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SIX4Q9UIU6 781 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HCN2Q9UL51 889 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SIN3BO75182 1162 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA9O76027 345 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 STC2O76061 302 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA10O95299 355 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PRKCGP05129 697 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 APRTP07741 180 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TNNI3P19429 210 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FBXW4P57775 412 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF234Q14588 700 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC14Q15048 493 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TAF5Q15542 800 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TCTN1Q2MV58 587 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL22Q6P050 247 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PJA1Q8NG27 643 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SHC3Q92529 594 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BAP1Q92560 729 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ULK4Q96C45 1275 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HMCESQ96FZ2 354 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BORCS6Q96GS4 357 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TWNKQ96RR1 684 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CDC6Q99741 560 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CDH19Q9H159 772 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 COMMD8Q9NX08 183 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ATRXP46100 2492 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 E9PAM4 449 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PEX12O00623 359 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM163BP0C2L3 166 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A4P14672 509 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GLULP15104 373 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ERCC2P18074 760 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ITPKAP23677 461 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GRM3Q14832 879 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ELOCQ15369 112 aa4.5□□□□□ -1.69
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