RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 OAZ1P54368 228 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNMB4Q86W47 210 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF567Q8N184 647 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ITPKCQ96DU7 683 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 APBA2Q99767 749 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 CD300AQ9UGN4 299 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 TIPRLO75663 272 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 BAIAP3O94812 1187 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 STXBP2Q15833 593 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 C16orf87Q6PH81 154 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC185Q8N715 623 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 C12orf29Q8N999 325 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM1BQ8NB78 822 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 REPS2Q8NFH8 660 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 PICK1Q9NRD5 415 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 INHBBP09529 407 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GABRB3P28472 473 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CSRP3P50461 194 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SQLEQ14534 574 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DHFR2Q86XF0 187 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM50Q86XT4 487 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 AKT1S1Q96B36 256 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GPR22Q99680 433 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SMOXQ9NWM0 555 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 USP21Q9UK80 565 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SOBPA7XYQ1 873 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 B4GALT5O43286 388 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MMP10P09238 476 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 COL6A2P12110 1019 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PKDCCQ504Y2 493 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CCNYQ8ND76 341 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GMLQ99445 158 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ACAD9Q9H845 621 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.51■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF839A8K0R7 811 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NPHS1O60500 1241 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ESRRBO95718 433 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 UGT1A6P19224 532 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FUT4P22083 530 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 UGT1A1P22309 533 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 UGT1A4P22310 534 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 UGT1A3P35503 534 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 UGT1A5P35504 534 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB17Q13105 803 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GRM3Q14832 879 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MOGQ16653 247 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 OR2T3Q8NH03 318 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ADI1Q9BV57 179 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FZD8Q9H461 694 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ALDH2P05091 517 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAJB1P25685 340 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 HALP42357 657 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GLRBP48167 497 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC12A1Q13621 1099 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GPR107Q5VW38 600 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PID1Q7Z2X4 250 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM167AQ96KS9 214 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms