RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMD3O43242 534 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 MT-CO1P00395 513 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 APODP05090 189 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAXP61244 160 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOAP61586 193 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMA5AQ13591 1074 aa27.87■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOOK3Q86VS8 718 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TERB1Q8NA31 727 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ART4Q93070 314 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SHOC2Q9UQ13 582 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 HS3ST2Q9Y278 367 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 EYSQ5T1H1 3165 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC730098B7Z3J9 87 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD160O95971 181 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACCSLQ4AC99 568 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM215Q68D42 235 aa27.86■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 UCMAQ8WVF2 138 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGME1Q9BQP7 344 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELOVL2Q9NXB9 296 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKAG3Q9UGI9 489 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G4CQ9UP65 541 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVW-1Q9UQF0 538 aa27.86■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRIA2P42262 883 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX9P48436 509 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 STK19P49842 368 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 GEMP55040 296 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST8SIA6P61647 398 aa27.85■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TDGQ13569 410 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYCP2LQ5T4T6 812 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADHFE1Q8IWW8 467 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGBD5Q8N414 524 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.053e-10■■■■■ 88.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 K7ERQ8 282 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 KAT7O95251 611 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK16Q00536 496 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ11Q14654 390 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP9Q49MG5 647 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH2D3CQ8N5H7 860 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO25Q8TCJ0 367 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa27.84■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RY13Q9BPV8 354 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCUBE2Q9NQ36 999 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERLIN1O75477 346 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRCP12931 536 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPSB2P20231 275 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSC2Q02487 901 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPSAB1Q15661 275 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC24Q6UX98 284 aa27.83■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAT8LQ8N9F0 302 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHFRQ96EP1 664 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP44Q9C0F1 390 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM153AQ9UHL3 310 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIAS3Q9Y6X2 628 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa27.82■■■□□ 2.04
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRD3Q15059 726 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD22Q5VYY1 191 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHTF2Q8N3S3 785 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA22Q8NHS9 363 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SORCS1Q8WY21 1168 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOC2Q96KP1 924 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRRT4C9JH25 899 aa27.82■■■□□ 2.04
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