RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298130.4

SPTSSA-201, Transcript of serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTSSA, Length 2,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSA-201ENST00000298130 TINF2Q9BSI4 451 aa24.75■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 IL22Q9GZX6 179 aa24.75■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 NDFIP2Q9NV92 336 aa24.75■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 KCNE1P15382 129 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PMLP29590 882 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 HASPINQ8TF76 798 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 GAD1Q99259 594 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 STK39Q9UEW8 545 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SBF1O95248 1867 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 BTBD19C9JJ37 291 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CDH17Q12864 832 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CNGA3Q16281 694 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 GK5Q6ZS86 529 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CHST12Q9NRB3 414 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.74■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ATP6V1B1P15313 513 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 GALNT2Q10471 571 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SEPT6Q14141 434 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TAC4Q86UU9 113 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 HDAC11Q96DB2 347 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CENPKQ9BS16 269 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 FICDQ9BVA6 458 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 FAM192AQ9GZU8 254 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 WDR41Q9HAD4 459 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 MIOSQ9NXC5 875 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TSPAN8P19075 237 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 BIRC2Q13490 618 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ZNF423Q2M1K9 1284 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 IYDQ6PHW0 289 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 UGT2A3Q6UWM9 527 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PSMD13Q9UNM6 376 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CDYLQ9Y232 598 aa24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ART3Q13508 389 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PCSK7Q16549 785 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 C11orf91Q3C1V1 193 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ZNF789Q5FWF6 425 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ELMO2Q96JJ3 720 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 LRGUKQ96M69 825 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 VCX3BQ9H321 246 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 RHOJQ9H4E5 214 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 DDHD2O94830 711 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 NPY2RP49146 381 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ACOT9Q9Y305 439 aa24.72■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CCL22O00626 93 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 KIF3CO14782 793 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CHN2P52757 468 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TAS2R39P59534 338 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 MFSD10Q14728 455 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SPATA24Q86W54 205 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 EPAS1Q99814 870 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PKP2Q99959 881 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ADA2Q9NZK5 511 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 MYL3P08590 195 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 BDNFP23560 247 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 ARNTP27540 789 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PGFP49763 221 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PIGGQ5H8A4 983 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 NTAN1Q96AB6 310 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 GABRDO14764 452 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 DNAJA2O60884 412 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 KCNA5P22460 613 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 PRDX6P30041 224 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 SLC1A2P43004 574 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 CSHL1Q14406 222 aa24.71■■□□□ 1.55
SPTSSA-201ENST00000298130 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms