RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 VPS45Q9NRW7 570 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 MTSS1O43312 755 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 WDR47O94967 919 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 BNIP3Q12983 259 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 GALNT18Q6P9A2 607 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 C1orf127Q8N9H9 656 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 BDH2Q9BUT1 245 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 SDCBP2Q9H190 292 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 RBP1P09455 135 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 SEPHS1P49903 392 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 GNA12Q03113 381 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 CCDC185Q8N715 623 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 UBR7Q8N806 425 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 HTRA1Q92743 480 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 FAM210AQ96ND0 272 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 FIZ1Q96SL8 496 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 C9orf16Q9BUW7 83 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.9■□□□□ 0.14
USP43-201ENST00000285199 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ENTPD1P49961 510 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TIGD2Q4W5G0 525 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CYP4B1P13584 511 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PDSS2Q86YH6 399 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DYTNA2CJ06 578 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CES1P23141 567 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 WNT7BP56706 349 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 HORMAD1Q86X24 394 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ESAMQ96AP7 390 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ABHD8Q96I13 439 aa15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ASB14A6NK59 587 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FGFR1P11362 822 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RAP1GDS1P52306 607 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TIMM22Q9Y584 194 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SLC2A4P14672 509 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DPEP1P16444 411 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CCNA2P20248 432 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ADORA2AP29274 412 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TAGAPQ8N103 731 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RORBQ92753 470 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FAR2Q96K12 515 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CCDC154A6NI56 674 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KCNH1O95259 989 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ASLP04424 464 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GEMP55040 296 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ITGA7Q13683 1181 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ADGRE1Q14246 886 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TLR1Q15399 786 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 STYK1Q6J9G0 422 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ITFG1Q8TB96 612 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TCF12Q99081 682 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms