RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SCOCQ9UIL1 159 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NEMP1O14524 444 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 DSC2Q02487 901 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 IGSF8Q969P0 613 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NSL1Q96IY1 281 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC9A7Q96T83 725 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GBA3Q9H227 469 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SNX15Q9NRS6 342 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 B2RBV5 119 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 BNIP3LO60238 219 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TLR5O60602 858 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PSMG1O95456 288 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 IGHA2P01877 340 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 C1QAP02745 245 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SEMA3BQ13214 749 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MPP3Q13368 585 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 IRF5Q13568 498 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PEX6Q13608 980 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NAT14Q8WUY8 206 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 LRRC39Q96DD0 335 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 THTPAQ9BU02 230 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TRIM4Q9C037 500 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TASP1Q9H6P5 420 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 A0A096LPK6 155 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 OR51F1A6NGY5 319 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 AHCYL1O43865 530 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ACVRL1P37023 503 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 USP4Q13107 963 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TNFRSF10BO14763 440 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 AURKAO14965 403 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 KRT34O76011 436 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PGM1P36871 562 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ETV4P43268 484 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GALNT2Q10471 571 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CFAP157Q5JU67 520 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MON1AQ86VX9 555 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF276Q8N554 614 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SMIM14Q96QK8 99 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 VCXQ9H320 206 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 HIPK3Q9H422 1215 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PPCSQ9HAB8 311 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PNPOQ9NVS9 261 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CABYRO75952 493 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CYP11A1P05108 521 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PLK1P53350 603 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC34A1Q06495 639 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CDH17Q12864 832 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 FBXL22Q6P050 247 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 LGI2Q8N0V4 545 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SERPINB11Q96P15 392 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 KCNK13Q9HB14 408 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TLK1Q9UKI8 766 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 KCTD3Q9Y597 815 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 EOMESO95936 686 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GP5P40197 560 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MAGEA3P43357 314 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC18A2Q05940 514 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GRM3Q14832 879 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 C4orf22Q6V702 233 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 DENND1CQ8IV53 801 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 HDAC11Q96DB2 347 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms