RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 FBXO40Q9UH90 709 aa6.4□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 MID2Q9UJV3 735 aa6.4□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.4□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.4□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.4□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.4□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC160A6NGH7 325 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 VWA5AO00534 786 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CILPO75339 1184 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 TNNC2P02585 160 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 EDN1P05305 212 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 GLDCP23378 1020 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SLC1A6P48664 564 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CD300CQ08708 224 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 KYAT1Q16773 422 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 EPGNQ6UW88 154 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 C16orf89Q6UX73 402 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 GPR141Q7Z602 305 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 RDH11Q8TC12 318 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CPXM1Q96SM3 734 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 DOK1Q99704 481 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF302Q9NR11 478 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ILVBLA1L0T0 632 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 YKT6O15498 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 THRAP10827 490 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 PRKACAP17612 351 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 GPD2P43304 727 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SELENBP1Q13228 472 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 STK11Q15831 433 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 IER5Q5VY09 327 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 IFNL1Q8IU54 200 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 RNF169Q8NCN4 708 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 DNERQ8NFT8 737 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ATP2A3Q93084 1043 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CFAP36Q96G28 342 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SCYL1Q96KG9 808 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SAMD11Q96NU1 681 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 VPS35Q96QK1 796 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SERPINI1Q99574 410 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 MECRQ9BV79 373 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 RNF38Q9H0F5 515 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CD93Q9NPY3 652 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 RNF146Q9NTX7 359 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 TFPTP0C1Z6 253 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 COL6A1P12109 1028 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 PGAM1P18669 254 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 PTPN9P43378 593 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 HAAOP46952 286 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 CPA2P48052 419 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 AQP4P55087 323 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SOX10P56693 466 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 DYNLT1P63172 113 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ADAM17P78536 824 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 KDSRQ06136 332 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 POU5F1BQ06416 359 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 SMARCB1Q12824 385 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 DLG1Q12959 904 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 ADGRE1Q14246 886 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-201ENST00000237247 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms