RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NDUFS2O75306 463 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LEFTY1O75610 366 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GSRP00390 522 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ITPKAP23677 461 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GKP32189 559 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DNA2P51530 1060 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CREB5Q02930 508 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 IL10RBQ08334 325 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RNF157Q96PX1 679 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 SGK2Q9HBY8 427 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 IL36AQ9UHA7 158 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 FZD4Q9ULV1 537 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ZNF487B1APH4 448 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 SPOPO43791 374 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 MAFKO60675 156 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LRP3O75074 770 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 MPLP40238 635 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CNTN1Q12860 1018 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TAZQ16635 292 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 MYLK3Q32MK0 819 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 AGBL4Q5VU57 503 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 VSIG1Q86XK7 387 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CCDC114Q96M63 670 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 HSPA12BQ96MM6 686 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 OMDQ99983 421 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PI4KAP42356 2102 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LRRD1A4D1F6 860 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 MFSD11O43934 449 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 SEMA4FO95754 770 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PRNPP04156 253 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TNNT1P13805 278 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RGRP47804 291 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 MARCKSL1P49006 195 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R38P59533 333 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PLD5Q8N7P1 536 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 KRT35Q92764 455 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 MUSKO15146 869 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 INSIG1O15503 277 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PSTPIP1O43586 416 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ZNF806P0C7X5 589 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 MAOBP27338 520 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CCZ1BP86790 482 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CSRP2Q16527 193 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 DAAM2Q86T65 1068 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1328Q86T90 577 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 GANCQ8TET4 914 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PIGKQ92643 395 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 FOXJ1Q92949 421 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 HINFPQ9BQA5 517 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ORAI3Q9BRQ5 295 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PATE3B3GLJ2 98 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP6O43182 974 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KRT1P04264 644 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-34P06331 123 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB6P35237 376 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ADPRHP54922 357 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 RHOAP61586 193 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms