RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 MYH3P11055 1940 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SHBGP04278 402 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KRT8P05787 483 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HLA-DPA1P20036 260 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SULT2A1Q06520 285 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ITGA7Q13683 1181 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LPPQ93052 612 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 WDR41Q9HAD4 459 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 M0R3G1 203 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FZD9O00144 591 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB22O15209 634 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LGR5O75473 907 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ENDOD1O94919 500 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6V0D1P61421 351 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF384Q8TF68 577 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD8Q96I13 439 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 QRFPRQ96P65 431 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HGH1Q9BTY7 390 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ACP6Q9NPH0 428 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MAN1A2O60476 641 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TBL1XO60907 577 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CALCAP01258 141 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF23P17027 643 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GPC1P35052 558 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MARCKSL1P49006 195 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC34A1Q06495 639 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DHFR2Q86XF0 187 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PHF21BQ96EK2 531 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ACBD6Q9BR61 282 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC28A1O00337 649 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PCDH8O95206 1070 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FTH1P02794 183 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FASP25445 335 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KRT20P35900 424 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA17Q96L03 361 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TTPALQ9BTX7 342 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 VPS51Q9UID3 782 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SNX6Q9UNH7 406 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C4BP0C0L5 1744 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GUCY1B2O75343 617 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 EOMESO95936 686 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TYMPP19971 482 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R1BP30154 601 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NEK3P51956 506 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2A13Q16696 494 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MOB2Q70IA6 237 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MTSS1LQ765P7 747 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MED8Q96G25 268 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BDH2Q9BUT1 245 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PQ67 120 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GJB1P08034 283 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ANXA5P08758 320 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CCT8P50990 548 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FAM187BQ17R55 369 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LIPMQ5VYY2 423 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GPR141Q7Z602 305 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DENND1CQ8IV53 801 aa6.54□□□□□ -1.36
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