RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 ANO4Q32M45 955 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 NPNTQ6UXI9 565 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 LINC00523Q86TU6 105 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 LCA5Q86VQ0 697 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MON1AQ86VX9 555 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CHSY1Q86X52 802 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 LRRC43Q8N309 656 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 RNF169Q8NCN4 708 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FBF1Q8TES7 1133 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TTC17Q96AE7 1141 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SPATA17Q96L03 361 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 GBA3Q9H227 469 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 WDCPQ9H6R7 721 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SCML2Q9UQR0 700 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 COL4A6Q14031 1691 aa8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FAM92AA1XBS5 289 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MAGEB16A2A368 324 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 WASH4PA8MWX3 477 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 HCRTO43612 131 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TYROBPO43914 113 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 BEST1O76090 585 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FSBPO95073 299 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ASMTLO95671 621 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 AP2A1O95782 977 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FYNP06241 537 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 USP17L7P0C7H9 530 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CA4P22748 312 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 GCAP28676 217 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 RFC2P35250 354 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CCNFP41002 786 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 IFNAR2P48551 515 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 NME3Q13232 169 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FYB2Q5VWT5 728 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TAC4Q86UU9 113 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF276Q8N554 614 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ATP2A3Q93084 1043 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 P2RY11Q96G91 374 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TSGA13Q96PP4 275 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms