RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619644.4

SMTN-223, Transcript of smoothelin, human

TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-223	ENST00000619644	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	STRADA	Q7RTN6	431 aa		14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SNX27	Q96L92	541 aa		14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PTPN3	P26045	913 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PIK3R1	P27986	724 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NMBR	P28336	390 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GRM3	Q14832	879 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	POU6F1	Q14863	301 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	UNC93A	Q86WB7	457 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DDI1	Q8WTU0	396 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ADA2	Q9NZK5	511 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SUPT3H	O75486	399 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	LIMK2	P53671	638 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	POU5F1B	Q06416	359 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CTBP1	Q13363	440 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NOTUM	Q6P988	496 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DPP9	Q86TI2	863 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TNIP3	Q96KP6	325 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644		A0A1B0GTW7	788 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DFFA	O00273	331 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	MT-CO1	P00395	513 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NR1H2	P55055	460 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	BORA	Q6PGQ7	559 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	POTEA	Q6S8J7	498 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ERO1B	Q86YB8	467 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	LRRC43	Q8N309	656 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SNX31	Q8N9S9	440 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FNDC8	Q8TC99	324 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	THEG	Q9P2T0	379 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	USP3	Q9Y6I4	520 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM233	B4DJY2	109 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF195	O14628	629 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	USP17L7	P0C7H9	530 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TAF6	P49848	677 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	THOP1	P52888	689 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CDKL1	Q00532	357 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ADGRE1	Q14246	886 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	INSC	Q1MX18	579 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	WSCD1	Q658N2	575 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	EPGN	Q6UW88	154 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KY	Q8NBH2	561 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SERPINI1	Q99574	410 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PTPRF	P10586	1907 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NRP1	O14786	923 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	THRA	P10827	490 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NOS2	P35228	1153 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CCNA1	P78396	465 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SEPT6	Q14141	434 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RNF169	Q8NCN4	708 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	IPMK	Q8NFU5	416 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	WNT8B	Q93098	351 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NPAS2	Q99743	824 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644		G3V2L1	256 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TOMM70	O94826	608 aa		14.68	□□□□□ -0.06

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