RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	GSC2	O15499	205 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF623	O75123	536 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PROC	P04070	461 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	FYN	P06241	537 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CPA3	P15088	417 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PAM	P19021	973 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	NFKB1	P19838	968 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TYMP	P19971	482 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PGM1	P36871	562 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC1A6	P48664	564 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	SCNN1G	P51170	649 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	GEM	P55040	296 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CRADD	P78560	199 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	MXRA7	P84157	204 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	SREBF2	Q12772	1141 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	MPP3	Q13368	585 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TUSC3	Q13454	348 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCLAF	Q15004	111 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAF11	Q15544	211 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCL14	Q16627	93 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	UPP1	Q16831	310 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANO4	Q32M45	955 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	C17orf99	Q6UX52	265 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM135	Q86UB9	458 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAC4	Q86UU9	113 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCNMB4	Q86W47	210 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TEKT5	Q96M29	485 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CEP41	Q9BYV8	373 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF19A	Q9NV58	838 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	COPG2	Q9UBF2	871 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	UTRN	P46939	3433 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CAPN14	A8MX76	684 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	HHLA1	C9JL84	531 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408		F8W8V4	182 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408		M0QZQ0	153 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRIG2	O94898	1065 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	HSPA4L	O95757	839 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	GNRH1	P01148	92 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	IGHA2	P01877	340 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CTSH	P09668	335 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	TPBGL	P0DKB5	382 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERVK-10	P10266	1014 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC2A3	P11169	496 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	RALB	P11234	206 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	AOC1	P19801	751 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCNC	P24863	283 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRDX6	P30041	224 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCR1	P32246	355 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAP1GDS1	P52306	607 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	FCGRT	P55899	365 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	NKX3-2	P78367	333 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	MGAT3	Q09327	533 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	RCN2	Q14257	317 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	MUM1	Q2TAK8	710 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCTD11	Q693B1	232 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM171B	Q6P995	826 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	DCLK2	Q8N568	766 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	NPW	Q8N729	165 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-222	ENST00000592408	STON2	Q8WXE9	905 aa		9.36	□□□□□ -0.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms