RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SUSD6	Q92537	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF4B	Q92750	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FGF13	Q92913	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS16	Q9H269	839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM170A	A1A519	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRD	O14764	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DCX	O43602	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TACC1	O75410	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FKBP9	O95302	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	VNN2	O95498	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MPIG6B	O95866	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	C1R	P00736	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CALCA	P01258	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CSH1	P0DML2	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CSH2	P0DML3	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC130	P13994	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CEBPB	P17676	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PTMS	P20962	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SOX5	P35711	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	VIPR2	P41587	438 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FNTB	P49356	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZXDA	P98168	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	OCRL	Q01968	901 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TDG	Q13569	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	STX1A	Q16623	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	USP7	Q93009	1102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NACA2	Q9H009	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63

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