RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM79Q9BSE2 394 aa5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PORCNQ9H237 461 aa5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PHIPQ8WWQ0 1821 aa5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 A0A1W2PPC4 97 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PLIN1O60240 522 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 ARP10275 920 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MYL4P12829 197 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 KCNA5P22460 613 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GALNSP34059 522 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 DGKQP52824 942 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 HMGCS2P54868 508 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP10-11P60412 298 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GPS1Q13098 491 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 RALBP1Q15311 655 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 WDR78Q5VTH9 848 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 KSR2Q6VAB6 950 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GPR142Q7Z601 462 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TMTC2Q8N394 836 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 ARNTL2Q8WYA1 636 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 CUL5Q93034 780 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TEKT1Q969V4 418 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 VPS4AQ9UN37 437 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PLXNA3P51805 1871 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TECTAO75443 2155 aa5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 UTYO14607 1347 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PRR23AA6NEV1 266 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TIMP1P01033 207 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 CA3P07451 260 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MYL3P08590 195 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 CYBAP13498 195 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 IDEP14735 1019 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GYG1P46976 350 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 JAK3P52333 1124 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 KCNJ12Q14500 433 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 FAM209BQ5JX69 171 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 RMDN1Q96DB5 314 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MUTYHQ9UIF7 546 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 GAKO14976 1311 aa5.48□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 ADAM10O14672 748 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 NDST3O95803 873 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 FGBP02675 491 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 TACR3P29371 465 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 MAPK4P31152 587 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PLCD1P51178 756 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 YPEL5P62699 121 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF91Q05481 1191 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 SPP2Q13103 211 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 BFSP2Q13515 415 aa5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ATXN3-218ENST00000553309 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms