RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TAMM41Q96BW9 452 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PFDN5Q99471 154 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 NAGPAQ9UK23 515 aa6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PGM1P36871 562 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 BCAT1P54687 386 aa6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TEAD4Q15561 434 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MAJINQ3KP22 176 aa6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 MPP7Q5T2T1 576 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ERAP2Q6P179 960 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 WDR93Q6P2C0 686 aa6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 C18orf8Q96DM3 657 aa6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CFL2Q9Y281 166 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 ETS2P15036 469 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TLR1Q15399 786 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HYIQ5T013 277 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TTC27Q6P3X3 843 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SLC51BQ86UW2 128 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 CLOCKO15516 846 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 LRRN2O75325 713 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 CRHR2Q13324 411 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf60Q96EN9 201 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 EPC1Q9H2F5 836 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TBX20Q9UMR3 447 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SPACA6W5XKT8 324 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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