RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	GIPC1	O14908	333 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	GJB3	O75712	270 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CD27	P26842	260 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PPP2CB	P62714	309 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PPP2CA	P67775	309 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SLC20A2	Q08357	652 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	VSTM4	Q8IW00	320 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ARRDC3	Q96B67	414 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	HMCES	Q96FZ2	354 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	DNAJC7	Q99615	494 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CEP44	Q9C0F1	390 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GVT2	93 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	LRRC72	A6NJI9	287 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CBFA2T2	O43439	604 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CYP1A2	P05177	515 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TPM3	P06753	285 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	IL1R2	P27930	398 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ETFB	P38117	255 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TAS2R38	P59533	333 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	BTBD6	Q96KE9	485 aa		21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	WNT9A	O14904	365 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	KDELR3	O43731	214 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	KCNK5	O95279	499 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SYP	P08247	313 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	KCNA4	P22459	653 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CCR5	P51681	352 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TPI1	P60174	286 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ARSI	Q5FYB1	569 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	VPS36	Q86VN1	386 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	NETO2	Q8NC67	525 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TMIE	Q8NEW7	156 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SLC6A18	Q96N87	628 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	IL21R	Q9HBE5	538 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		21.28	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PPC4	97 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	RASA4B	C9J798	803 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SLC7A4	O43246	635 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	RASA4	O43374	803 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PRPSAP2	O60256	369 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	LEFTY1	O75610	366 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CD59	P13987	128 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	DES	P17661	470 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	DNA2	P51530	1060 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CARD16	Q5EG05	197 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PIP4P1	Q86T03	277 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CCDC114	Q96M63	670 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	NUP85	Q9BW27	656 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	LRRC19	Q9H756	370 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	IL36A	Q9UHA7	158 aa		21.27	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SPEG	Q15772	3267 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	LAT	O43561	262 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	RNF8	O76064	485 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PRNP	P04156	253 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	GK	P32189	559 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HTR7	P34969	479 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PCK1	P35558	622 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SERINC3	Q13530	473 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	KIF19	Q2TAC6	998 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	RFX8	Q6ZV50	586 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	DEFB124	Q8NES8	71 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99

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