RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550155.5

CNOT2-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2

Gene CNOT2, Length 842 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-222	ENST00000550155	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ACKR2	O00590	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KRT86	O43790	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KCNJ13	O60928	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	AMT	P48728	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PDCL	Q13371	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KRT81	Q14533	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155		E7EVH7	732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	LDB2	O43679	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	LYL1	P12980	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	YWHAQ	P27348	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SERPINB3	P29508	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	DPP6	P42658	865 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	HTR3A	P46098	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	MCM2	P49736	904 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PKP1	Q13835	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	BLMH	Q13867	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	RUBCN	Q92622	972 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155		A0A096LPK6	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155		H0Y3Z8	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SERPINI2	O75830	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KRT38	O76015	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CBX6	O95503	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PNPLA4	P41247	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	HNF4G	Q14541	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	BRD3	Q15059	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	LDB3	O75112	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	METTL18	O95568	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	IL1A	P01583	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CYP21A2	P08686	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ACP5	P13686	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TNNT1	P13805	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	AVPR2	P30518	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	THPO	P40225	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	GPR12	P47775	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CLCN5	P51795	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	FOXO1	Q12778	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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