RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 H0Y626 953 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 KRT37O76014 449 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SAT1P21673 171 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 NMBRP28336 390 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 WNT3AP56704 352 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IRX4P78413 519 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GNA12Q03113 381 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SERINC3Q13530 473 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZNF235Q14590 738 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 QPCTQ16769 361 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 AFMIDQ63HM1 303 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RASSF3Q86WH2 238 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ELMOD1Q8N336 334 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SPOCK2Q92563 424 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CDKL2Q92772 493 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ATP2A3Q93084 1043 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IL21Q9HBE4 155 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FNIP2Q9P278 1114 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 REV3LO60673 3130 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LINC01553A4QN01 128 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 WASH4PA8MWX3 477 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MUSKO15146 869 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GRM6O15303 877 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TBL1XO60907 577 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PEX11BO96011 259 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SLC4A1P02730 911 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 C1QAP02745 245 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CA3P07451 260 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RHOCP08134 193 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PIRTP0C851 137 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 NEFHP12036 1026 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PRKCHP24723 683 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SCNN1BP51168 640 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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CS-215ENST00000549143 NR1H3Q13133 447 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SLC1A5Q15758 541 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PARP15Q460N3 678 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FSCBQ5H9T9 825 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DDI1Q8WTU0 396 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FCRL5Q96RD9 977 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SEMA3CQ99985 751 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CASS4Q9NQ75 786 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TLR9Q9NR96 1032 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SNAP91O60641 907 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LPXNO60711 386 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 VAPBO95292 243 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PRKCGP05129 697 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ADRA1DP25100 572 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GMPRP36959 345 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CCR2P41597 374 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PGGT1BP53609 377 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PDE1BQ01064 536 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZNF33AQ06730 810 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CDH18Q13634 790 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IHHQ14623 411 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HHATQ5VTY9 493 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PGBD5Q8N414 524 aa8.55□□□□□ -1.04
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