RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.21□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SCN3BQ9NY72 215 aa10.21□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.21□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ZNF536O15090 1300 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 MEI4A8MW99 385 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 FKBP6O75344 327 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PROCP04070 461 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ABHD2P08910 425 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 DSG1Q02413 1049 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CTBP1Q13363 440 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 TP53BP2Q13625 1128 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PTPRNQ16849 979 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PMF1Q6P1K2 205 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ZNF614Q8N883 585 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 OR56A4Q8NGH8 313 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 TFAP2BQ92481 460 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ASB8Q9H765 288 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ITM2BQ9Y287 266 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 DERAQ9Y315 318 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ACTL7BQ9Y614 415 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 DAB1O75553 588 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 OCM2P0CE71 109 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 TFEBP19484 476 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ADSSP30520 456 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 WNT3AP56704 352 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CNTN1Q12860 1018 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ACOX1Q15067 660 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 NOMO1Q15155 1222 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SLC10A6Q3KNW5 377 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 C11orf74Q86VG3 221 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 GPSM1Q86YR5 675 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 BBS7Q8IWZ6 715 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 KLHL5Q96PQ7 755 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 NDNQ99608 321 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SEPHS2Q99611 448 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SH3GL1Q99961 368 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CROTQ9UKG9 612 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 MYH1P12882 1939 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CHD4Q14839 1912 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 TBC1D3BA6NDS4 549 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 INPP4BO15327 924 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 OR56A5P0C7T3 313 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CYP2A7P20853 494 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ATP6V1B2P21281 511 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 TAF10Q12962 218 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PLCL1Q15111 1095 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 IYDQ6PHW0 289 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 LRRC8DQ7L1W4 858 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 TTC7BQ86TV6 843 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SPPL2BQ8TCT7 592 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ARL15Q9NXU5 204 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ZMYM5Q9UJ78 669 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 LY75O60449 1722 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 M0R3G1 203 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 USP1O94782 785 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SMPD1P17405 629 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PAX3P23760 479 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ABL2P42684 1182 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 FBXL19Q6PCT2 694 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 CCDC149Q6ZUS6 474 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 MON1BQ7L1V2 547 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 XYLT1Q86Y38 959 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 LRRC49Q8IUZ0 686 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 OMDQ99983 421 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-201ENST00000537686 FKTNO75072 461 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms