RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533836.1

BTF3L4-208, Transcript of basic transcription factor 3 like 4, human

TSL 4

Gene BTF3L4, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BTF3L4-208	ENST00000533836	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836		H3BNX3	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	BMP15	O95972	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	IL1A	P01583	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CHRM4	P08173	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	LMO1	P25800	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	PPAT	Q06203	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836		Q5PR19	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836		B4DGG1	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836		H0YGN5	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	PER2	O15055	1255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ADA	P00813	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SERPINC1	P01008	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	YWHAQ	P27348	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	DPP6	P42658	865 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	GPD2	P43304	727 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	POLD2	P49005	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ME3	Q16798	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	HSPH1	Q92598	858 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TOMM40	O96008	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SCP2	P22307	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	MAPK7	Q13164	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	NFIL3	Q16649	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	HTRA1	Q92743	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TBATA	Q96M53	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	EYA3	Q99504	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3L4-208	ENST00000533836	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BTF3L4-208	ENST00000533836	MYMK	A6NI61	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BTF3L4-208	ENST00000533836	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BTF3L4-208	ENST00000533836	HSPB6	O14558	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BTF3L4-208	ENST00000533836	CEP104	O60308	925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BTF3L4-208	ENST00000533836	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BTF3L4-208	ENST00000533836	CHRNB2	P17787	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms