RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT3Q9UH03 358 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 KRBA1A5PL33 1030 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 GCATO75600 419 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 SRCP12931 536 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN3P26045 913 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 NNMTP40261 264 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 NUMBP49757 651 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB17Q13105 803 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 ENPP2Q13822 863 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 CA14Q9ULX7 337 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF103O00237 685 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 TMCC1O94876 653 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 JCHAINP01591 159 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP13P45452 471 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 GDF10P55107 478 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 P3H1Q32P28 736 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 BBS5Q8N3I7 341 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 TEKT5Q96M29 485 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA13Q96N96 652 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 NELL2Q99435 816 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 CARD6Q9BX69 1037 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 HCN2Q9UL51 889 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-205ENST00000528462 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 SGK1O00141 431 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 OPHN1O60890 802 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 GAS8O95995 478 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 EGFP01133 1207 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ZXDAP98168 799 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf54Q08AI8 447 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 CYTH1Q15438 398 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 PLPP6Q8IY26 295 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 CNTD1Q8N815 330 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC114Q96M63 670 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT12Q99456 494 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM245Q9H330 911 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 K7ERQ8 282 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ECEL1O95672 775 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ST8SIA6P61647 398 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF567Q8N184 647 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 FRS2Q8WU20 508 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 MGME1Q9BQP7 344 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 CD72P21854 359 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 PTGIRP43119 386 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 DR1Q01658 176 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF234Q14588 700 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF235Q14590 738 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 DLG2Q15700 870 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 C4orf22Q6V702 233 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 SIX5Q8N196 739 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC89Q8N998 374 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-205ENST00000528462 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.36■■□□□ 1.17
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