RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	SLC2A3	P11169	496 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CEACAM1	P13688	526 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TCF3	P15923	654 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	GGCX	P38435	758 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DGKE	P52429	567 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ITGA8	P53708	1063 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PMS2	P54278	862 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DYNLT1	P63172	113 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PAK5	Q9P286	719 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PTPRB	P23467	1997 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131		H7C0C1	242 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	AGPS	O00116	658 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	IRAK2	O43187	625 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	OPRD1	P41143	372 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ATP5O	P48047	213 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	IFNAR2	P48551	515 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ZXDB	P98169	803 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	GPS1	Q13098	491 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PDK1	Q15118	436 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CA9	Q16790	459 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DDR2	Q16832	855 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	P3H1	Q32P28	736 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	RAB6C	Q53S08	254 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	EPAS1	Q99814	870 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PLAA	Q9Y263	795 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131		A6NNZ2	444 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131		H3BQF6	201 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131		K7EQS6	105 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	TP73	O15350	636 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	MTSS1	O43312	755 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MEG3-223	ENST00000524131	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5

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