RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 DYTNA2CJ06 578 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC38A8A6NNN8 435 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASA4BC9J798 803 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TULP2O00295 520 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNMTO43148 476 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCGR2AP12318 317 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CKMT1AP12532 417 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANOS1P23352 680 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPH2P23942 346 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TYK2P29597 1187 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCP4P48539 62 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DLG1Q12959 904 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB30Q15771 203 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYTL3Q4VX76 610 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF144BQ7Z419 303 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMIM29Q86T20 159 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINA11Q86U17 422 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC8Q8TAM2 541 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNJ9Q92806 393 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM18Q96B42 140 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTBPQ96DY7 904 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 FEM1CQ96JP0 617 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1B0GVM2 712 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM247A6NEH6 219 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIP5K1BO14986 540 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNPH1O43598 174 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NCK2O43639 380 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 LARGE1O95461 756 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CH25HO95992 272 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRYAAP02489 173 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFSF4P23510 183 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL3P39023 403 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP12AP54707 1039 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PKP1Q13835 747 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC6Q16204 474 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM209BQ5JX69 171 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM268Q5VZI3 342 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGBD5Q8N414 524 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX45Q8NA69 505 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF485Q8NCK3 441 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SORCS1Q8WY21 1168 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUX3Q96PT4 197 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMP28Q9H239 520 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 EVA1AQ9H8M9 152 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDE11AQ9HCR9 933 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM248Q9NWD8 314 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAB2Q9UQC2 676 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0A0MQY5 61 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0U1RQJ8 604 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFC1BP0CG36 223 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFC1P0CG37 223 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPPBP16860 134 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNA5P22460 613 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRP5P59047 1200 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTFR2Q6P444 385 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBA1AQ71U36 451 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR5BQ86VZ2 330 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF114Q8NC26 417 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGLYRP2Q96PD5 576 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRG2BQ96QU4 278 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR1F2PQ96R84 312 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBA1CQ9BQE3 449 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TM7SF3Q9NS93 570 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRM8O00222 908 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYN3O14994 580 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF18O76093 207 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPP6P42658 865 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP4A11Q02928 519 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDK18Q07002 472 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TROAPQ12815 778 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CALCRLQ16602 461 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTBD16Q32M84 506 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 GXYLT1Q4G148 440 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms