RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513134.5

TMA16-208, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 3 BASIC

Gene TMA16, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-208	ENST00000513134	NETO2	Q8NC67	525 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MFSD11	O43934	449 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF217	O75362	1048 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	GSR	P00390	522 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	PYGM	P11217	842 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	KRT10	P13645	584 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TNNT1	P13805	278 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CSNK1D	P48730	415 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	NR2C2	P49116	596 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TPMT	P51580	245 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	RWDD2B	P57060	319 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	RNF103	O00237	685 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	DFFA	O00273	331 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TMCC1	O94876	653 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	FTCD	O95954	541 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CTSL	P07711	333 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MX2	P20592	715 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	C5AR1	P21730	350 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CCNC	P24863	283 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CHRNA3	P32297	505 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	NHLH1	Q02575	133 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TFDP2	Q14188	446 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CST6	Q15828	149 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	FRMD1	Q8N878	549 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MAML1	Q92585	1016 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	LHX3	Q9UBR4	397 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134		R4GN57	208 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMA16-208	ENST00000513134	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMA16-208	ENST00000513134	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TMA16-208	ENST00000513134	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMA16-208	ENST00000513134	APOL1	O14791	398 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMA16-208	ENST00000513134	MUSK	O15146	869 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMA16-208	ENST00000513134	MATN3	O15232	486 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMA16-208	ENST00000513134	CST8	O60676	142 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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