RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	ETV5	P41161	510 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RGS7	P49802	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	NUCB2	P80303	420 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	USP7	Q93009	1102 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ALG14	Q96F25	216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	YY2	O15391	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FYN	P06241	537 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	NNT	Q13423	1086 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF34	Q969K3	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC61	Q9BV99	259 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	C9orf172	C9J069	976 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PDXK	O00764	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FPGT	O14772	594 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CD19	P15391	556 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CD97	P48960	835 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	MAPK10	P53779	464 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	OXCT1	P55809	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	STK4	Q13043	487 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CUL4B	Q13620	913 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CLPB	Q9H078	707 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276		F5H5T6	163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276		O00370	1275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	MAPK13	O15264	365 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	MTSS1	O43312	755 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	APOE	P02649	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PRNP	P04156	253 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TSHR	P16473	764 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CD82	P27701	267 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PFN3	P60673	137 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RABEP1	Q15276	862 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TAC4	Q86UU9	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ARL10	Q8N8L6	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FEM1C	Q96JP0	617 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TBATA	Q96M53	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	AGFG2	O95081	481 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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