RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
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SH3BP2-215ENST00000510074 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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SH3BP2-215ENST00000510074 DEFB106AQ8N104 65 aa16.22■□□□□ 0.19
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP2-215ENST00000510074 SNX21Q969T3 373 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP2-215ENST00000510074 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
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SH3BP2-215ENST00000510074 KLF15Q9UIH9 416 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP2-215ENST00000510074 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A1W2PQ27 194 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A1W2PQ64 194 aa16.19■□□□□ 0.18
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