RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCNA1Q09470 495 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCNYQ8ND76 341 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IFNKQ9P0W0 207 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNTN3Q9P232 1028 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC28A1O00337 649 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAP3K6O95382 1288 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPR3P17342 541 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC26A3P40879 764 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRKCEQ02156 737 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRM2Q14416 872 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM126BQ8IUX1 230 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM192Q8IY95 271 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDCPQ9H6R7 721 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TADA2AO75478 443 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 REM1O75628 298 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZMYND10O75800 440 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TDP2O95551 362 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MPP2Q14168 576 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHL12Q53G59 568 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF358Q9NW07 568 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPR160Q9UJ42 338 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPPAP01160 153 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF75DP51815 510 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAM1Q15629 374 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MDM1Q8TC05 714 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP3R2Q96LZ3 170 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AMDHD1Q96NU7 426 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa4.59□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR2AG2A6NM03 316 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 H3BNX3 289 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDUFS2O75306 463 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EPN2O95208 641 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYC1P08574 325 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP6V1C1P21283 382 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNF1BP35680 557 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCL15Q16663 113 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHADLQ6NUI6 762 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EPB41L4BQ9H329 900 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAAP1Q9H8G2 361 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TULP3O75386 442 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC1A2P43004 574 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCP10Q12799 353 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRTP1Q5TC63 336 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTI2Q6NXR4 508 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KAT2BQ92831 832 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CALN1Q9BXU9 219 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAS2R50P59544 299 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPR135Q8IZ08 494 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms