RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	C11orf74	Q86VG3	221 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PIGK	Q92643	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SP110	Q9HB58	689 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SARDH	Q9UL12	918 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	KNL1	Q8NG31	2342 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024		A0A0U1RQJ8	604 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024		J3KR12	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	MCF2L	O15068	1137 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	TMCC1	O94876	653 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	EPN2	O95208	641 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CD160	O95971	181 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ADH1B	P00325	375 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RET	P07949	1114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	COMT	P21964	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	IL4R	P24394	825 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	OXTR	P30559	389 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	GK	P32189	559 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CHRNA3	P32297	505 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ACSL1	P33121	698 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ARSE	P51690	589 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CLCN6	P51797	869 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	GSDMD	P57764	484 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ZBTB16	Q05516	673 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CARD16	Q5EG05	197 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	TSC1	Q92574	1164 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC114	Q96M63	670 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ALG6	Q9Y672	507 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	MEI4	A8MW99	385 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PRAMEF11	O60813	436 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	MAP3K6	O95382	1288 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SEMA4F	O95754	770 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	KRT1	P04264	644 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CTSL	P07711	333 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	C5AR1	P21730	350 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ITPKA	P23677	461 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	KDELR1	P24390	212 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	MAOB	P27338	520 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SLC1A1	P43005	524 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	VAV2	P52735	878 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RHOA	P61586	193 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF33A	Q06730	810 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PDK2	Q15119	407 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	TCEAL1	Q15170	157 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	LLGL1	Q15334	1064 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		10	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	LZTR1	Q8N653	840 aa		10	□□□□□ -0.81

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