RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 POM121BA6NF01 834 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LMO7DNF2Z398 122 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 STMND1H3BQB6 276 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 M0QYV0 167 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 AGRPO00253 132 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PIK3R2O00459 728 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PDXKO00764 312 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 CCKBRP32239 447 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 C1orf61Q13536 156 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FAXCQ5TGI0 409 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KRT39Q6A163 491 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RBFAQ8N0V3 343 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 ARL10Q8N8L6 244 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TMIEQ8NEW7 156 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 UBA3Q8TBC4 463 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 CATSPER2Q96P56 530 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 USP28Q96RU2 1077 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 MUC3BQ9H195 1237 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 GCATO75600 419 aa6.29□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 PLK1P53350 603 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CCL7P80098 99 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PPARDQ03181 441 aa6.29□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 SEPT6Q14141 434 aa6.29□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.29□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 FHL5Q5TD97 284 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TAC4Q86UU9 113 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CCNJLQ8IV13 435 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KYQ8NBH2 561 aa6.29□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.29□□□□□ -1.4
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