RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 NUMBP49757 651 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 MTA1Q13330 715 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SPIDRQ14159 915 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 EXTL1Q92935 676 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 KLF15Q9UIH9 416 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 VPS28Q9UK41 221 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.58□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PPFIA2O75334 1257 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 LIPCP11150 499 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PFKFB1P16118 471 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 JUNDP17535 347 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC5A2P31639 672 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CLCN6P51797 869 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 NFKB2Q00653 900 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 DPYDQ12882 1025 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FGL2Q14314 439 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 MEA1Q16626 185 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FBXL22Q6P050 247 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 C14orf80Q86SX3 495 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 STK32AQ8WU08 396 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SPASTQ9UBP0 616 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SEPT3Q9UH03 358 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CFAP45Q9UL16 551 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 HPSEQ9Y251 543 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RELNP78509 3460 aa14.57□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 MUSKO15146 869 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 AP1G1O43747 822 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 BNIP3LO60238 219 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CLDN11O75508 207 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM87AP0C7U9 286 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PRR29P0C7W0 189 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 GP1BBP13224 206 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CMA1P23946 247 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CCR1P32246 355 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 GPD2P43304 727 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 NEK3P51956 506 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 KRT83P78385 493 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CENPCQ03188 943 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 C5orf22Q49AR2 442 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 LMX1AQ8TE12 382 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 LMO7DNF2Z398 122 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FPGTO14772 594 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PMM2O15305 246 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RAD51BO15315 384 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 MT-CO1P00395 513 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 ITGB7P26010 798 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 UGT1A5P35504 534 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PFN3P60673 137 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TLE1Q04724 770 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 LRMPQ12912 555 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 ASB12Q8WXK4 309 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC35C1Q96A29 364 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FEM1CQ96JP0 617 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 NT5C1BQ96P26 610 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 MED15Q96RN5 788 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PSMB7Q99436 277 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 STRADBQ9C0K7 418 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 THAP9Q9H5L6 903 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 ST7Q9NRC1 585 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF40A-211ENST00000493468 IL36AQ9UHA7 158 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms