RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	LYL1	P12980	280 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	MYD88	Q99836	296 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	BMPR1B	O00238	502 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	AVPR2	P30518	371 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GNAL	P38405	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PCP4	P48539	62 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CLCNKB	P51801	687 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SP1	P08047	785 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	DAO	P14920	347 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GSTM2	P28161	218 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PPM1A	P35813	382 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	MXI1	P50539	228 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	BUB3	O43684	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NODAL	Q96S42	347 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PIGS	Q96S52	555 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	EYA2	O00167	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ITM2A	O43736	263 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SOCS5	O75159	536 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SERPINI2	O75830	405 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	ACTL6B	O94805	426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MMP3	P08254	477 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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