RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R38P59533 333 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 GNA12Q03113 381 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC3Q13217 504 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 KRT31Q15323 416 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 HORMAD1Q86X24 394 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CHST14Q8NCH0 376 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ARRDC3Q96B67 414 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 GBP4Q96PP9 640 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 GANQ9H2C0 597 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 KNL1Q8NG31 2342 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 LEFTY1O75610 366 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 PRLRP16471 622 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 MMP8P22894 467 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 NEK3P51956 506 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CYP4F3Q08477 520 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CARD16Q5EG05 197 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TRNP1Q6NT89 227 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 NEK11Q8NG66 645 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CALN1Q9BXU9 219 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 HDAC8Q9BY41 377 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SDC3O75056 442 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 KRT3P12035 628 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 DESP17661 470 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ADRA1BP35368 520 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 KLK7P49862 253 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 FMO1Q01740 532 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ILKQ13418 452 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 BNIPLQ7Z465 357 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 FEM1CQ96JP0 617 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 FANCLQ9NW38 375 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 DKK4Q9UBT3 224 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS20P59510 1910 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 AKAP13Q12802 2813 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD62A6NC57 917 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 RHOQP17081 205 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CKMT2P17540 419 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 L1CAMP32004 1257 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 MAPKAPK2P49137 400 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ACADVLP49748 655 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 DAB2P98082 770 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CCDC14Q49A88 953 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 STRADAQ7RTN6 431 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 NXPE2Q96DL1 559 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ANO10Q9NW15 660 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 DNAI1Q9UI46 699 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 RAXQ9Y2V3 346 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ITGB7P26010 798 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 PTPN9P43378 593 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 JAM2P57087 298 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ARF5P84085 180 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ZNF284Q2VY69 593 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 FZD3Q9NPG1 666 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.53■□□□□ 0.88
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